Образуването на еукариотната клетка е второто най-важно (след появата на самия живот) еволюционно събитие. Основната и фундаментална разлика между еукариотите и прокариотните организми е наличието на по-напреднала геномна система. Благодарение на появата и развитието на клетъчното ядро, степента на адаптивност на едноклетъчните организми към редовно променящите се условия на съществуване и способността им бързо да се адаптират, без да се внасят значителни наследствени промени в генната система, рязко нараснаха.
Еукариотната клетка, чиято цитоплазма е зона на активни метаболитни процеси, успешно отделена от зоната на съхранение, четене и редупликация на генетична информация, се оказа способна на по-нататъшна биологична еволюция. Това епохално и съдбовно еволюционно събитие, според учените, се е случило не по-късно от 2,6 милиарда години на кръстопътя на два геоложки етапа - архейски и протерозойски.
Растежът на адаптивността и стабилността на биологичните структури е задължително условие за пълноценна биологична еволюция. Именно благодарение на високата си способност за адаптация еукариотната клетка е в състояние да еволюира до многоклетъчни организми със сложна структурна организация. Всъщност в многоклетъчните биологични системи клетките с един и същ геном, адаптиращи се към променящите се условия, образуват тъкани, които са напълно различни, както по своите морфологични свойства, така и по функционалност. Това е голямата еволюционна победа на еукариотите, която доведе до появата на такова грандиозно разнообразие от форми на живот на планетата и навлизането на еволюционната арена на самия човек.
Структурата на клетките от еукариотен тип има няколко характерни черти, които не са характерни за прокариотите. Еукариотната клетка съдържа голямо количество генетичен материал (90%), който е концентриран в хромозомни структури, което осигурява тяхната диференциация и специализация. Всяка еукариотна клетка се характеризира с наличието на отделно ядро. Това е основната отличителна черта на този тип клетки. Друга важна разлика от прокариотите са органелите на еукариотната клетка - постоянни и разнообразни вътреклетъчни структури.
Еукариотната клетка, в сравнение с прокариотната, има по-сложна многоетапна система за възприемане на различни вещества. В природата няма типична универсална клетка от еукариотен тип. Всички тяххарактеризиращ се с невероятно разнообразие, което се дължи именно на необходимостта от еволюционна адаптация. Много важна характеристика на еукариотите е присъщата им компартментализация – локализирането на всички биохимични процеси в отделни клетъчни отделения, разделени от вътреклетъчна мембрана. Еукариотите имат редица сложни структурни компоненти. Като например мембранната система; цитоплазмен матрикс, който е основното вътреклетъчно вещество; клетъчните органели са основните функционални компоненти на еукариотите.