В биологията, за да се опише конкретен организъм, който принадлежи към царствата на животни, гъби или растения, е разработена собствена номенклатура. Той отразява принадлежността към един вид, в зависимост от характеристиките на морфологията и външния вид. За животните се прилагат критериите за отнасяне към даден вид, в зависимост от способността да произвеждат плодовито потомство по време на оплождането. Тези модели обаче се отнасят само за тези организми, докато микробите не могат да бъдат класифицирани по този начин.
Концепцията за щам в микробиологията
Поради наличието на огромен брой организми, които имат морфологични свойства, но различни биохимични и имунологични характеристики, е невъзможно да се приложи стандартна номенклатура за именуване. В резултат на това беше въведено такова понятие като щам. Това е чиста култура от микроби, която е изолирана и изолирана на определено място в определен час.
Всеки микроб, който принадлежи към един щам, е подобен на друг такъв представител по отношение на биохимични, морфологични, имунологични и генетични критерии. Но в рамките на един и същи бактериален вид такава аналогия не се наблюдава. Следователно щамът е по-гъвкаво име за микробна култура. Защото бързообменът на генетичен материал (мутация) води до появата на нови организми в рамките на един вид, но с различни свойства, именно това определение ни позволява да характеризираме по-точно факторите на патогенност и вирулентност.
Бактериални щамове
Съществуващата номенклатура на бактериите позволява да се класифицират видовете организми, но не характеризира новите им свойства. Последните се появяват в резултат на бърза мутация, придобивайки нови свойства, включително патогенни за хората, селскостопанските животни и растения, както и други микроби. Пример за номенклатура, използващ примера на Escherichia coli, изглежда така: царство - бактерии, тип - Proteobacteria, клас гама-протеобактерии, ред - Enterobacteriales, семейство Enterobacteria. Родът е Escherichia, а видът Escherichia colli. Въпреки това, има много култури от бактерии от вида Escherichia colli, показващи различни свойства. Те са изолирани в отделни щамове бактерии и имат допълнително име. Например, Escherichia colli O157:H7.
E.coli сама по себе си присъства в човешките черва и не причинява заболяване, но щамът O157:H7 е изключително патогенен поради наличието на голям брой фактори на вирулентност. Тя е преживяла епидемия от ентеротоксигенни заболявания през последните 5 години.
Вирусни щамове
Концепцията за щам е гъвкаво име за организми със същите свойства, които са били изолирани, след което идентифицирани и описани в определена област в определено време. С хода си вирусът може да придобие нови свойства, дължащи се на антигенностдрейф. Това ще създаде нов вирусен щам, вероятно по-патогенен от неговия родител.
Можете ясно да покажете появата на нови щамове, като използвате примера на грипния вирус. Той принадлежи към семейството на ортомиксовирусите и се нарича в зависимост от антигените (хемаглутинини и невраминидаза) HxNy. X и Y са числови стойности, отразяващи наличието на антигени. Пример за това е H5N1, известен с неотдавнашната епидемия от свински грип с бързо прогресиращи хеморагични пневмонии. Според теорията от този щам може да се развие нов и по-опасен щам поради същия антигенен дрейф.
Гъбични щамове и протистни щамове
Плесените са най-малко променливи от всички микроби, въпреки че тяхната биохимия също е сложна. Поради по-сложна структура от бактериите и вирусите, а също и поради липсата на механизми за бърз генен трансфер, броят на новите гъбични щамове се увеличава леко. Има също мнение, че всеки новооткрит гъбичен щам е вече съществуващ организъм, който просто не е попадал на изследователите.
Подобна ситуация съществува в царството на протистите. Способността им да мутират е ниска, така че вероятността новите щамове да се появят бързо е изключително малка. Въпреки това все още се появяват нови варианти на организми от същия вид. Следователно, очевидно, те също са съществували по-рано, но не са били открити.
